介绍
1. 技术介绍
宏蛋白组学是应用蛋白质组学技术对微生物群落进行研究的一项新技术，在特定的时间对微生物群落的所有蛋白质的组成进行大规模的定性和定量分析。
宏蛋白组学通过鉴定代谢酶和其他蛋白质的时间与空间丰度，可以补充通过宏基因组学和宏转录组学获得的遗传潜力和基因表达信息。
由于微生物群代谢酶序列的变异性，宏蛋白组学数据可以提供 “哪个微生物体在做什么” 的见解，并能识别导致指定代谢物丰度变化的微生物组的特定成员，促进DNA信息与代谢物生产之间的联系。同时通过蛋白质的检测，可以帮助解开微生物之间及微生物与环境之间的相互作用。
图1 宏蛋白质组（Petriz BA, Franco OL. Metaproteomics as a Complementary Approach to Gut Microbiota in Health and Disease. Front Chem. 2017 Jan 26;5:4. ）
2. 研究挑战
• 微生物组成复杂，样本制备难
• 蛋白丰度跨度大，质谱检测难
• 计算资源要求高，数据搜索难
3. 技术优势
西湖欧米通过对粪便样本进行批量前处理后，采用高灵敏度4D DIA方法进行微生物肽段采集，且在数据搜库及分析方面，自建了完善的宏蛋白建库及搜库流程，摒弃了传统蛋白质组数据分析方法，采用了更加符合微生物组数据规律的分析流程，从而完成对大规模粪便样本的整合分析。
自主创新高通量流程，分析结果快速准确
4D-DIA前沿技术平台，更灵敏更多菌群蛋白
千人以上队列研究经验，一站式组学分析方案
4. 技术流程
样本收集→ 菌群富集→ 酶解消化 → 质谱数据采集 → 数据分析
5. 技术应用
· 筛选疾病标志物
· 检测致病菌的功能状态助力疾病监测
· 发掘疾病治疗的药物新靶点
欧米服务
西湖欧米提供高深度、高质量、高平行性的宏蛋白组学检测分析服务。
质谱仪
Bruker timsTOF Pro
参考文献
1. Bossche, et al. The Metaproteomics Initiative: a coordinated approach for propelling the functional characterization of microbiomes. Microbiome. 2021 Dec 20; 9(1): 243
2. Petriz, et al. Metaproteomics as a Complementary Approach to Gut Microbiota in Health and Disease. Front Chem. 2017 Jan 26; 5: 4
3. Wang, et al. Metaproteomics: A strategy to study the taxonomy and functionality of the gut microbiota. J Proteomics. 2020 May 15; 219: 103737
