PulseDIA 定量蛋白质组学

PulseDIA 技术是西湖欧米的专利技术，在传统的 DIA 技术的基础上，将一个窗口根据质荷比分割成更小范围的多个窗口，并将这些窗口以脉冲的方式均匀分配至不同的质谱方法进行采集。同一个样本分成多次短梯度进样，每次进样方法均有不同的质谱窗口，最后合并分析几次采集的质谱数据，达到更高的多肽和蛋白质鉴定量。

应用场景：需要获得最高深度蛋白质组的临床队列课题

1. 1. 西湖欧米专利技术，在常规 DIA 的基础上提升蛋白鉴定数量 10%-30%；
2. 2. 结合 PCT 样本前处理技术，可以实现临床微量样本（如FFPE、穿刺活检、泪液等）的高深度蛋白质定量分析，组织样本最低送样量只需 0.1 mg。

Bruker timsTOF Pro

Thermo Orbitrap Exploris 480

Mol Cell Proteomics | 深度 DIA 蛋白质组学鉴定慢性髓系白血病获得性耐药的靶向调节因子

为了解 K562 细胞对甲磺酸伊马替尼 (IMA) 和阿霉素 (ADR) 耐药的潜在机制，用低剂量 IMA 或 ADR 处理 K562 细胞 2 个月，根据耐药指数的增加判断其对药物的轻、中、重度耐药。基于 PulseDIA 定量蛋白质组学技术从数据集中总共鉴定和量化了 98232 种肽的 7082 种蛋白质。发现 Sirtuin 信号通路在耐 ADR 和耐 IMA 的 K562 细胞中显著富集。特别是，IDH2 被确定为与耐药表型相关的潜在药物靶标。